Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms