Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms