Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Urb2E9Q7L1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms