Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga10E9Q6R1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms