Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Simc1E9Q6E9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms