Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC051665E9Q623 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC051665E9Q623 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms