Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20518E9Q548 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms