Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pgbd1E9Q492 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms