Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms