Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms