Protein–RNA interactions for Protein: E9Q289

Acbd4, Acyl-Coenzyme A-binding domain-containing 4, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd4E9Q289 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms