Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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NebE9Q1W3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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