Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms