Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3893E9Q1I1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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