Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms