Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ryr1E9PZQ0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms