Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms