Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms