Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930444G20RikD3Z741 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930444G20RikD3Z741 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms