Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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