Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5478D3Z6R0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms