Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nkx6-2D3Z4R4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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