Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms