Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm3543D3Z235 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm3543D3Z235 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm3543D3Z235 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm3543D3Z235 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm3543D3Z235 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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