Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms