Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm17333C6EQI3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17333C6EQI3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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