Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Pdzd8B9EJ80 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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