Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms