Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms