Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm6133B2RY53 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms