Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms