Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms