Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms