Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC035947B2RQY6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms