Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf3B2KF05 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms