Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H60cB1B213 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60cB1B213 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60cB1B213 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60cB1B213 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms