Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms