Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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