Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Trabd2bB1ATG9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Trabd2bB1ATG9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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