Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spocd1B1ASB6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms