Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms