Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms