Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp36B1AQJ2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms