Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp4A4UUI3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp4A4UUI3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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