Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatsperbA2RTF1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms