Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf39A2RT81 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf39A2RT81 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf39A2RT81 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf39A2RT81 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rnf39A2RT81 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rnf39A2RT81 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rnf39A2RT81 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rnf39A2RT81 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf39A2RT81 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms