Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Btbd35f28A2CFD5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms