Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms