Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r2A2AMT6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r2A2AMT6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms