Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SetxA2AKX3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SetxA2AKX3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SetxA2AKX3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SetxA2AKX3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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SetxA2AKX3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SetxA2AKX3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SetxA2AKX3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SetxA2AKX3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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